Mô phỏng Thành phần hoá học của tế bào

Chế độ nước vẽ các phân tử H₂O phân cực với đầu oxygen tích điện âm và hai đầu hydrogen tích điện dương; các liên kết hydrogen hiện thành nét đứt và số liên kết trung bình mỗi phân tử được đếm liên tục. Hạ nhiệt độ xuống dưới 0 °C thì mạng tinh thể nước đá hình thành với khoảng cách xa hơn nên nước đá nhẹ hơn nước lỏng; nâng lên 100 °C thì liên kết hydrogen đứt hết và nước bay hơi. Thả muối ăn hoặc đường vào thì phân tử nước bao quanh làm chúng tan, thả dầu thì không tan. Chế độ đại phân tử cho xem đơn phân của carbohydrate, lipid, protein và nucleic acid nối thành mạch.

Làm thí nghiệm ảo nhận biết đường khử (thuốc thử Benedict, đun cách thuỷ), tinh bột (iodine), protein (biuret) và lipid (Sudan III hoặc phép thử nhũ tương với ethanol) trên sữa, nước uống glucose, lòng trắng trứng, bánh mì, dầu ăn, khoai tây và 2–3 mẫu ẩn chọn ngẫu nhiên. Ghi kết quả vào bảng, ước lượng nồng độ đường khử theo thang màu Benedict rồi bấm kiểm tra để biết mình đã nhận ra các mẫu ẩn đúng chưa.

Mô hình 3D xoay được của protein: amino acid (nhóm amino, nhóm carboxyl, gốc R) nối bằng liên kết peptide qua phản ứng ngưng tụ thành chuỗi polypeptide; xoắn α và gấp nếp β giữ bằng liên kết hydrogen; cấu trúc bậc 3 giữ bằng liên kết hydrogen, liên kết ion, cầu disulfide và tương tác kị nước (bật, tắt được); hemoglobin gồm 4 chuỗi và 4 nhóm heme. Học sinh đổi nhiệt độ, pH, thêm chất khử hoặc gây đột biến để xem protein biến tính trên đường cong biến tính, so sánh collagen dạng sợi với hemoglobin dạng cầu và theo dõi con đường tiết protein. Có chế độ xem 2D.

Lắp ráp phân tử từ α-glucose và β-glucose (nhóm OH ở carbon 1 nằm dưới hay trên mặt vòng) bằng phản ứng ngưng tụ tạo liên kết 1,4- và 1,6-glycoside, giải phóng nước, thành maltose, sucrose, lactose, amylose, amylopectin, glycogen hoặc cellulose; thuỷ phân lại bằng acid hay enzyme đặc hiệu. Phần lipid nối glycerol với ba acid béo bằng liên kết ester thành triglyceride, so sánh acid béo no và không no (chỗ gập cis, nhiệt độ nóng chảy, cách đánh số ω, chỉ số iodine), dựng phospholipid đầu ưa nước đuôi kị nước tự xếp thành lớp kép trong nước và làm phép thử nhũ tương với ethanol. Có bảng cấu trúc – chức năng.